色渗透发生机理除了与颜料本身的特性如分子量、受水作用影响程度有关外，还与薄膜的特性有关。

颜料对薄膜的扩散渗透受聚合物分子的极性、结晶度、密度、分子排列的影响，取决于薄膜聚合物中高分子链进行热运动时，高分子之间形成孔穴的大小，以及当温度提高时孔穴扩张的情况。扩散渗透主要在非结晶区域进行。当温度较低时，颜料是不容易穿过薄膜的，这是因为低温时，颜料分子的能量较低，既不易克服分子间力，同时高分子链段的运动幅度较小，不足以产生颜料分子通过所需要的较大孔穴。对于经过拉伸定向以及结晶度较高的薄膜如PET、BOPP、HDPE等，由于分子排列规整度较高，即使在较高的温度下，其总蠕变量、蠕变速度仍然较低，分子链段运动困难，所以这类薄膜一般难以发生颜料色渗透问题。但对于尼龙、非线性聚乙烯等类型的薄膜来说，由于是无定型态，结晶程度低，分子间隙大，在较高温度时就易发生色渗透现象，特别是尼龙有热变形温度不高、尺寸不稳定、吸水量大、遇热水易降解等缺点，所以用尼龙薄膜制作的蒸煮袋、水煮袋使用时，容易渗透某些颜色。但在干燥状态时，这些颜料对尼龙薄膜的渗透作用减弱，这是因为消除了水分对尼龙薄膜及颜料的双重影响。

墨层中联结料色渗透的影响不是很强烈，这是因为颜料分子既然能克服内部分子间力运动，一般也就能克服颜料分子与联结料中树脂分子之间的作用力，而冲破联结料的“包围”发生迁移。但联结料中树脂分子的极性对颜料分子的运动迁移是有影响的，极性越强，迁移就越困难。例如青莲色、桃红等颜料在用松香树脂制作成的胶版油墨中的迁移程度，比在普通凹版复合油墨(氯化聚丙烯型)低，也就是这个原因。